- このセクションで使っている R packages
library(broom)
library(tidyverse)
library(patchwork)
library(stargazer)OLS などのパラメータ推定値が真の値からずれてしまう| 内容 | 問題点 | バイアスの種類 | 
|---|---|---|
| ✔ 必要な説明変数を含めない時 | 推定値にバイアスが生じる → 深刻 | 脱落変数バイアス (OVB) | 
| ✔ 入れるべきでない変数を含めた時 | 推定値にバイアスが生じる → 深刻 | 処置後変数バイアス | 
| ✔ 無関係な変数を含めた時 | 無益だが有害ではない | |
| \(Y\) | : 結果変数(健康状態) | 
| \(D\) | : 処置変数(0: 通院しない、1: 通院する) | 
| \(e\) | : 残差 | 
confounding variable)とは「脱落変数バイアスを生じさせるような変数」のこと「脱落変数バイアス」(Omitted Variable Bias: OVB) とは「必要な説明変数を含めない時のバイアス」
ここでは通院と健康状態の事例を使って解説する
「通院するかしないか」というセレクションは「もともとの健康状態 \(X\)」によって生じると仮定
「健康状態」\(Y\) を 「もともとの健康状態」\(X\) に回帰させる
ここで私たちが知りたいのは(平均処置効果: \(ATE\)) は \(\beta^l\) の値
「もともとの健康状態」\(X\) は「結果」\(Y\) と「処置」\(D\) の両方に影響を与えている交絡変数
→ モデルに含める必要あり
「もともとの健康状態」\(X\) を含む左側のモデル=正しいモデル
「もともとの健康状態」\(X\) を含間内右側のモデル=間違ったモデル
\[Y_i = \alpha^s + \beta^s D_i + u_i・・・(2)\]
\[Y_i = \alpha^l + \beta^l D_i + \gamma^l X_i + e_i・・・(1)\]
\[X_i = \alpha_0 + λD_i + ν_i・・・ (3)\]
\[Y_i = \alpha^l + \beta^l D_i + \gamma^l (\alpha_0 + λD_i + ν_i) + e_i ・・・(4)\]
\[Y_i = \alpha^l + \gamma^l\alpha_0 + (\beta^l + \gamma^lλ)D_i + e_i + \gamma^lν_i\]
| \((\beta^l + \gamma^lλ)\) | : 「間違ったモデル」(2) における傾き = \(\beta ^s\) | 
| \(\beta^l\) | : 私たちが知りたい平均処置効果: ATE | 
| \(\gamma^lλ\) | : 脱落変数バイアス: OBV | 
| \(\gamma^l\) | : 交絡変数 \(X\) と結果 \(Y\) の共変関係:\(Y_i = \alpha^l + \beta^lD_i + \gamma^lX_i + e_i\) | 
| \(λ\) | : 交絡変数 \(X\) と処置 \(D\) の共変関係:\(X_i = \alpha_0 + \gamma^lD_i + ν\) | 
| \(\alpha^l + \gamma^l\alpha_0\) | :「間違ったモデル」における切片 = \(\alpha^s\) | 
| \(e_i + \gamma^lν_i\) | 「間違ったモデル」における残差 \(u_i\) | 
まとめ  ・ \(\gamma^l\) か \(λ\) のどちらかがゼロならバイアスは生じない
・ \(\gamma^l≠0\) かつ \(λ≠0\) のとき、\(X\) を交絡変数(共変量)と呼ぶ
・ 交絡変数とは「脱落変数バイアスを生じさせる変数」のこと
・ 交絡変数をコントロールしないと、脱落変数バイアスが生じる
→ セレクションバイアスが除去されずに残り、因果効果が正しく推定できない
データの準備
学生20人の架空データ
散布図を描いてみる
「あつもりをやる時間」と「身長」には負の関係がある!
あつもりをやればやるほど背が伸びない?
理論的には考えられない
性別ごとに図を描き直してみる
→ 目的変数(説明したい変数)= 身長
→ 説明変数(説明する変数)=「あつもり」をやる時間/1週間あたり
→ 例えば「あつもりを週に 5 時間時間やる女性の身長は 165 cm」という予測は可能
→ 目的変数(説明したい変数)= 「あつもり」をやる時間/1週間あたり
→ 説明変数(説明する変数)= 身長
→ 例えば「身長が 1 cm 高い男性は、週あたりあつもりをやる時間が 1 時間増える」という因果推論は可能
→ しかし「男性があつもりを週あたり 1 時間やると身長が 1 cm 増える」という因果推論は考えられない
どの変数がどの変数に「影響するか」どうかという問題は統計学や統計的因果推論では解決できない
→ それぞれの専門分野における学問の蓄積をよく調べることが大切
計量経済学や計量政治学などの社会科学では、説明したい変数(=目的変数)を縦軸に、説明する変数(説明変数)を横軸にとるのが一般的
上の例で、もし「身長」で「あつもり」を説明したいのであれば次のような散布図を描く
 
OVB を確認する・衆議院議員総選挙の得票データ hr96-17.csv をダウンロード
→ RProject folder内の data フォルダに入れる
・ dataフォルダ内から read_csv で読み取り df というデータフレーム名をつける
df <- read_csv("data/hr96-17.csv")names(df) [1] "year"          "pref"          "ku"            "kun"          
 [5] "mag"           "rank"          "wl"            "nocand"       
 [9] "seito"         "j_name"        "name"          "term"         
[13] "gender"        "age"           "exp"           "status"       
[17] "vote"          "voteshare"     "eligible"      "turnout"      
[21] "castvotes"     "seshu_dummy"   "jiban_seshu"   "nojiban_seshu"exppv (有権者一人あたり選挙費用)の作成
exp と eligible を使って、有権者一人あたりに使う選挙費用 (exppv) を作る
exp と eligible のデータ型をチェック
str(df$eligible)   num [1:8803] 346774 338310 331808 315704 319846 ...eligible は数値型 → 問題なしstr(df$exp) chr [1:8803] "9828097" "12940178" "11245219" "12134215" "11894801" ...exp のデータ型が文字型 (chr) なので、数値型 (numeric) に変換する df$exp <- as.numeric(df$exp) mutate()関数を使って exppv を作るdf <- df %>% 
  mutate(exppv = exp / eligible) df_2012 と名前を付けるdf_2012 <- df %>% 
  filter(year == 2012) %>% 
  select(voteshare, term, exppv, turnout)R-Markdown で html 表示する際にはチャンクオプションで {r, results = “asis”} と指定するstargazer(as.data.frame(df_2012), 
          type ="html",
          digits = 2)| Statistic | N | Mean | St. Dev. | Min | Pctl(25) | Pctl(75) | Max | 
| voteshare | 1,294 | 23.18 | 17.11 | 0.20 | 8.50 | 34.62 | 84.50 | 
| term | 1,294 | 1.56 | 2.43 | 0 | 0 | 2 | 15 | 
| exppv | 1,280 | 17.18 | 13.50 | 0.001 | 6.11 | 23.66 | 94.59 | 
| turnout | 1,294 | 59.37 | 3.48 | 50.20 | 57.20 | 61.70 | 69.80 | 
| 変数名 | 詳細 | 
|---|---|
| voteshare | 得票率 (%) | 
| term | 当選回数 | 
| exppv | 有権者一人あたりに費やす選挙費用(円) | 
| turnout | 小選挙区の投票率 (%) | 
「当選回数」が欠落したケース
ここでは「当選回数」が交絡変数
「当選回数」は「選挙費用」と「得票率」の両方に影響を与えていると考えられる
当選回数の多いベテラン議員ほど資金に余裕があるので選挙にお金が使える(はず)← 理論から導かれる
交絡変数である「当選回数」をモデルに含めないとセレクションバイアスが生じる
「得票率」を \(Y\) 軸に指定した散布図を確認
exppv.vs <- ggplot(df_2012, aes(exppv, voteshare)) +
  geom_point() +
  labs(x = "選挙費用 (exppv)", 
       y = "得票率 (voteshare)",
       title = "得票率と選挙費用の散布図") +
  stat_smooth(method = lm) + # (method = lm, se = FALSE) → 95% 信頼区間が消える
  theme_minimal(base_family = "HiraKakuProN-W3") term.vs <- ggplot(df_2012, aes(term, voteshare)) +
  geom_point() +
  labs(x = "当選回数 (term)", 
       y = "得票率 (voteshare)",
       title = "得票率と当選回数の散布図") +
  stat_smooth(method = lm) + # (method = lm, se = FALSE) → 95% 信頼区間が消える
  theme_minimal(base_family = "HiraKakuProN-W3") library(patchwork)exppv.vs + term.vs予想どおり、どちらの説明変数も「得票率」とは正の相関がある
交絡変数である「当選回数」と「選挙費用」の関係を調べてみる
exppv.term <- ggplot(df_2012, aes(term, exppv)) +
  geom_point() +
  labs(x = "当選回数 (term)", 
       y = "選挙費用 (exppv)",
       title = "当選回数と選挙費用の散布図") +
  stat_smooth(method = lm) + # (method = lm, se = FALSE) → 95% 信頼区間が消える
  theme_minimal(base_family = "HiraKakuProN-W3") 
exppv.termこれも予想どおり、正の相関がある
次の二つの回帰分析を実行してみる
「正しいモデル」:選挙費用 (exppv) と当選回数 (term) をモデルに含める Model_1
「間違ったモデル」:選挙費用 (exppv) だけをモデルに含める Model_2
Model_1 <- lm(voteshare ~ exppv + term, data = df_2012)
Model_2 <- lm(voteshare ~ exppv, data = df_2012)stargazer()を使って表示させる{r, results = "asis"} と指定すること)stargazer(Model_1, Model_2,
                     type = "html",
                     digits = 2,
          style = "apsr",
          dep.var.caption = "得票率(%)", # 応答変数の名前
          dep.var.labels = "正しいモデル・・・・・間違ったモデル", # 応答変数の名前
          covariate.labels = c("選挙費用 (exppv)", # 変数名を変更  
                   "当選回数 (term)"),
          title = "(1): 正しいモデル & (2): 間違ったモデル") # タイトル| 正しいモデル・・・・・間違ったモデル | ||
| (1) | (2) | |
| 選挙費用 (exppv) | 0.55*** | 0.83*** | 
| (0.03) | (0.03) | |
| 当選回数 (term) | 3.17*** | |
| (0.14) | ||
| Constant | 8.81*** | 8.99*** | 
| (0.50) | (0.58) | |
| N | 1,280 | 1,280 | 
| R2 | 0.59 | 0.43 | 
| Adjusted R2 | 0.58 | 0.43 | 
| Residual Std. Error | 11.01 (df = 1277) | 12.91 (df = 1278) | 
| F Statistic | 901.44*** (df = 2; 1277) | 961.34*** (df = 1; 1278) | 
| p < .1; p < .05; p < .01 | ||
正しいモデル (1)
\[得票率= 8.81 + 0.55選挙費用 + 3.17当選回数 + e_i\]
間違ったモデル (2)
\[得票率= 8.99 + 0.83選挙費用 + u_i\]
結論 ・ モデルに本来入れるべき説明変数(ここでは「当選回数」)を含めないと、脱落変数バイアスのため「選挙費用」の係数が過大に評価される
・ ここでは 0.28パーセンテージ・ポイントだけ「選挙費用」が「得票率」に与える影響を過小評価されている
解説
0.55 は、「当選回数」が同じであると仮定した場合に、「選挙費用」だけを変えることによって「得票率」がどれだけ変化するかを測定した値0.83) には0.55) だけでなく、0.28)も含まれている→ 間違ったモデルでは「選挙費用」の係数を正しく推定できていない
まとめ  ・必要な説明変数をもモデルに入れない → 有害
・しかし、私たちは「世界の真の状態」を知ることはできない
解決策
→「関係していそうな説明変数は、できるだけ全てモデルに入れる」
→「コントロール変数」としてモデルに多くの変数を含める根拠
・しかし観測数 (N) が少ないときにコントロール変数を入れすぎる
→ 自由度を消費してしまうので注意が必要
投票率が得票率に影響を与えないと思われる理由  ・投票率が「特定の政党の候補者の得票率」に影響を与えることはあり得る
・例えば、経済的不況後の選挙では、政権与党全体の得票率は下がるはず
→ 政権与党に所属する候補者の得票率は下がるず
・しかし、ここでは「候補者全員の得票率」が分析対象
・特別の理由がない限り「投票率」が候補者全員の「得票率」に影響を与えるとは考えられない
ggplot(df_2012, aes(turnout, voteshare)) +
  geom_point() +
  labs(x = "投票率 (turnout)", 
       y = "得票率 (voteshare)",
       title = "投票率と得票率の散布図") +
  stat_smooth(method = lm) + # (method = lm, se = FALSE) → 95% 信頼区間が消える
  theme_minimal(base_family = "HiraKakuProN-W3") 予想どおり、ほとんど無相関
次の二つの回帰分析を実行する
turnout) をモデルに含めない Model_1turnout) をモデルに含めた Model_3Model_1 <- lm(voteshare ~ exppv + term,   
              data = df_2012)  
Model_3 <- lm(voteshare ~ exppv + term + turnout,   
              data = df_2012)stargazer()を使って表示させる{r, results = "asis"} と指定すること)stargazer(Model_1, Model_3,
                     type = "html",
                     digits = 2,
          style = "apsr",
          dep.var.caption = "得票率(%)", # 応答変数の名前
          dep.var.labels = "正しいモデル・・・・・間違ったモデル", # 応答変数の名前
          covariate.labels = c("選挙費用 (exppv)", # 変数名を変更  
                   "当選回数 (term)",
                   "投票率 (turnout)"),
          title = "(1): 正しいモデル & (2): 間違ったモデル") # タイトル| 正しいモデル・・・・・間違ったモデル | ||
| (1) | (2) | |
| 選挙費用 (exppv) | 0.55*** | 0.55*** | 
| (0.03) | (0.03) | |
| 当選回数 (term) | 3.17*** | 3.17*** | 
| (0.14) | (0.14) | |
| 投票率 (turnout) | -0.02 | |
| (0.09) | ||
| Constant | 8.81*** | 10.10* | 
| (0.50) | (5.26) | |
| N | 1,280 | 1,280 | 
| R2 | 0.59 | 0.59 | 
| Adjusted R2 | 0.58 | 0.58 | 
| Residual Std. Error | 11.01 (df = 1277) | 11.01 (df = 1276) | 
| F Statistic | 901.44*** (df = 2; 1277) | 600.53*** (df = 3; 1276) | 
| p < .1; p < .05; p < .01 | ||
正しいモデル (1)
\[得票率= 8.81 + 0.55選挙費用 + 3.17当選回数 + e_i\]
間違ったモデル (2)
\[得票率= 10.1 + 0.55選挙費用 + 3.17当選回数 - 0.02 投票率 + u_i\]
0.55) は同じ0.02 で統計的に有意ではない結論 モデルに本来入れるべきではない説明変数(投票率)を含めても、無益であっても有害ではない
解説
post treatment variable bias)  
「あつもり」が「身長」に与える処置効果(因果効果)を知りたいのなら(上の左側のグラフ)
→ このモデルで問題なし
交絡変数である「性別」をモデルに含めればセレクションバイアスを除去した「身長」が「あつもり」に与える処置効果 \(\gamma\) を推定できる
しかし「性別」が「あつもり」に与える因果効果を知りたいのなら(上の右側のグラフ)
→ 問題がある
データの準備
学生20人の架空データ atumori.csv をダウンロード
→ RProject folder内の dataフォルダに入れる
・ data フォルダ内から read_csv で読み取り df というデータフレーム名をつけ
回帰式は次のようになる
  
gender を男性 (male) なら 1、女性 (female) なら 0 に変更df <- mutate(df, gender = ifelse(gender == "male", 1, 0)) データの準備
RProject folder内の data フォルダに入れるdataフォルダ内から read_csv で読み取り df というデータフレーム名をつけるdf <- read_csv("data/atsumori.csv")df %>% 
  ggplot(aes(height, atsumori)) + 
  geom_point() +
  stat_smooth(method = lm, 
              se = FALSE) + 
  labs(x = "身長 (cm)", y = "「あつもり」をやる時間/ 1 週間あたり (hour)",
       title = "「あつもり」と「身長」の関係")  +
  theme_bw(base_family = "HiraKakuProN-W3")df %>% 
  ggplot(aes(height, atsumori)) + 
  geom_point(aes(color = gender)) + 
  geom_smooth(method = lm, 
              se = FALSE, 
              aes(color = gender)) +
 labs(x = "身長 (cm)", y = "「あつもり」をやる時間/ 1 週間あたり (hour)",
       title = "「あつもり」と「身長」の関係:男女別") +
  scale_color_discrete(name = "性別",
                       labels = c("女性", "男性")) +
  theme_bw(base_family = "HiraKakuProN-W3")負の相関は消える!
重回帰分析をしてみる
Model_1 <- lm(atsumori ~ height + gender, data = df){r, results = "asis"} と設定することstargazer(Model_1,
                     type = "html",
                     digits = 2,
          style = "apsr",
          dep.var.caption = "あつもりをする時間/1週間 (hour)", # 応答変数の名前
          covariate.labels = c("身長", # 変数名を変更  
                   "性別"),
          title = "「あつもりをする時間/1週間 (hour)」と「身長」の関係") # タイトル| atsumori | |
| 身長 | 0.14 | 
| (1.11) | |
| 性別 | -27.82*** | 
| (8.31) | |
| Constant | 11.46 | 
| (188.36) | |
| N | 20 | 
| R2 | 0.74 | 
| Adjusted R2 | 0.70 | 
| Residual Std. Error | 8.75 (df = 17) | 
| F Statistic | 23.62*** (df = 2; 17) | 
| p < .1; p < .05; p < .01 | |
\[あつもり_i = 11.46 - 27.82性別 + 0.14身長_i + e_i\]
解釈 ・ 「あつもり」と「身長」の間には関係はない
「性別」だけを含めた「正しいモデル」では、「性別」は「あつもり」に \(\beta\) という 影響を与えている
しかし「性別」と「身長」両方の変数を入れた「間違ったモデル」では「性別」が「あつもり」に与える影響は 2 つある:\(\beta^w\) と \(\gamma^w λ\) の二つ
「性別」→「身長」→「あつもり」という経路で、「性別」が「あつもり」に \(\gamma ^wλ\) という影響を与えていることに注意
\(β^w\) だけで判断すると「性別」が「あつもり」に与える影響を \(\gamma ^wλ\) 分だけ過小評価(もしくは過大評価)してしまう
「性別」の処置効果の一部 \(\gamma^w λ\) は「身長」を通じて「あつもり」に伝わる
  
| \(\beta\) | : 私たちが知りたい「性別」の因果効果(平均処置効果): ATE | 
| \(\beta^w\) | : 間違ったモデルで得られる「性別」の回帰係数 | 
| \(\gamma^w λ\) | :処置後変数バイアス | 
| \(\gamma^w\) と \(λ\) の符号が同じ場合 | : バイアスにより過小推定 | 
| \(\gamma^w\) と \(λ\) の符号が異なる場合 | : バイアスにより過大推定 | 
| \(\gamma^w\) または \(λ\) がゼロの場合 | : バイアスは生じない | 
回帰分析(予測 vs. 因果効果)  ・ 回帰分析を行う際には「予測したいのか」それとも「因果効果を確認したい」のかを明らかにする
・ 機械学習のように、例えば「あつもり」を「予測」したいのであれば「性別」を含め、できるだけ多くの変数をモデルに入れてコントロールし、大きな寄与率 \(R^2\) を求める
・ 「性別」が「あつもり」に与える処置効果を確認したいのなら、処置後変数である「身長」はモデルには入れない
・ 処置効果を確認したいのなら、寄与率 \(R^2\) の値は気にしなくてもいい
  
  
right_model <- lm(atsumori ~ gender, data = df)
broom::tidy(right_model)# A tibble: 2 x 5
  term        estimate std.error statistic  p.value
  <chr>          <dbl>     <dbl>     <dbl>    <dbl>
1 (Intercept)     35.2      2.69     13.1  1.25e-10
2 gendermale     -26.9      3.81     -7.07 1.36e- 6結果 ・「正しいモデル」と比べると「間違ったモデル」は「性別 \(X\)」が「あつもり \(Y\)」に与える因果効果を 0.924 ポイントだけ過大評価していることがわかる
fig_1 <- df %>% 
  ggplot(aes(gender, atsumori)) + 
  geom_point() +
  stat_smooth(method = lm, 
              se = FALSE) + 
  labs(x = "性別(女性=0、男性=1)", y = "あつもりする時間 /週あたり (hour)",
       title = "「あつもり」と「性別」の関係")  +
  theme_bw(base_family = "HiraKakuProN-W3")fig_2 <- df %>% 
  ggplot(aes(height, atsumori)) + 
  geom_point() +
  stat_smooth(method = lm, 
              se = FALSE) + 
  labs(x = "身長 (cm)", y = "あつもりする時間 /週あたり (hour)",
       title = "「あつもり」と「身長」の関係")  +
  theme_bw(base_family = "HiraKakuProN-W3")fig_1 + fig_2Model_2 <- lm(atsumori ~ height + gender, data = df)stargazer を使って示す{r, results = "asis"} と設定することstargazer(Model_2,
                     type = "html",
                     digits = 2,
          style = "apsr",
          dep.var.caption = "あつもりをする時間/1週間 (hour)", # 応答変数の名前
          covariate.labels = c("身長 (cm)", # 変数名を変更  
                   "性別"),
          title = "「あつもりをする時間/1週間 (hour)」と「身長」の関係") # タイトル| atsumori | |
| 身長 (cm) | 0.14 | 
| (1.11) | |
| 性別 | -27.82*** | 
| (8.31) | |
| Constant | 11.46 | 
| (188.36) | |
| N | 20 | 
| R2 | 0.74 | 
| Adjusted R2 | 0.70 | 
| Residual Std. Error | 8.75 (df = 17) | 
| F Statistic | 23.62*** (df = 2; 17) | 
| p < .1; p < .05; p < .01 | |
broom() 関数を使って、簡単に結果を表示することもできるbroom::tidy(Model_2)# A tibble: 3 x 5
  term        estimate std.error statistic p.value
  <chr>          <dbl>     <dbl>     <dbl>   <dbl>
1 (Intercept)   11.5      188.      0.0609 0.952  
2 height         0.140      1.11    0.126  0.901  
3 gendermale   -27.8        8.31   -3.35   0.00380\[あつもり_i = 11.5 - 27.8性別 + 0.14身長_i + e_i・・・(1)\]
Model_3 <- lm(height ~ gender, data = df)stargazer(Model_3, 
                     type = "html",
                     digits = 2,
          style = "apsr",
          dep.var.caption = "身長",
          title = "「身長」と「性別」の関係") # タイトル| height | |
| gendermale | 6.60*** | 
| (0.83) | |
| Constant | 169.70*** | 
| (0.59) | |
| N | 20 | 
| R2 | 0.78 | 
| Adjusted R2 | 0.77 | 
| Residual Std. Error | 1.86 (df = 18) | 
| F Statistic | 63.03*** (df = 1; 18) | 
| p < .1; p < .05; p < .01 | |
\[身長_i = 169.7 + 6.6性別 + ν_i・・・(2)\]
\[あつもり_i = 11.5 - 27.8性別 + 0.14身長_i + e_i\\ = 11.5 - 27.8性別 + 0.14(169.7 + 6.6性別 + ν_i) + e_i\\ = 35.22 + (-27.8 + 0.14・6.6)性別 + 0.14ν_i + e_i\\ = 35.22 -26.9 + 0.14ν_i + u_i\\ = 35.22 -26.9 + e_i\\\]
| \(\beta = -26.9\) | : 私たちが知りたい「性別」の因果効果(平均処置効果): ATE | 
| \(\beta^w = -27.8\) | : 間違ったモデルで得られる「性別」の回帰係数 | 
| \(\gamma^w λ = 0.924\) | :処置後変数バイアス | 
| \(\gamma^w\) と \(λ\) の符号が同じ場合 | : バイアスにより過小推定 | 
| \(\gamma^w\) と \(λ\) の符号が異なる場合 | : バイアスにより過大推定 | 
| \(\gamma^w\) または \(λ\) がゼロの場合 | : バイアスは生じない | 
解釈  ・「性別」が「あつもり」に与える因果効果 \(\beta = -26.9\)
・処置後変数である「身長」をモデルに加えたために「性別」の回帰係数は \(\beta^w = -27.8\) と表示される
・\(\gamma^w\) と \(λ\) の符号が異なる
→ 処置後変数バイアスのため「性別」が「あつもり」に与える因果効果を 0.924 ポイントだけ過大推定してしまう